Сегментация клеток с помощью opencv и python

[Сегментация клеток с помощью opencv и python]

В 26.01.2018 at 17:19, 2expres сказал:

Привет! Я правильно понимаю, что это студенческая задача?

Решается она через "порог". Задав значение 67 ты получишь результат, но будет полно мелких сегментов. Тебе нужно или удалить или не считать сегменты размер, которых меньше 400 пикселей. Моя программа удаляет сегменты, результат ниже.

P.S. Число сегментов около 320 шт.

P.P.S. Можешь попробовать порог Оцца и последующую сегментацию.

 

Спасибо за ответ. Задача не студенческая, это тестовое задание. 

Буду пробовать порог Оцу.

[Сегментация клеток с помощью opencv и python]

2 минуты назад, mrgloom сказал:

Чем то похоже

https://www.kaggle.com/c/data-science-bowl-2018

 

Сколько у вас картинок? Есть ли разметка?

Картинка всего одна. Тут врятли получится применить машинное обучение. Думаю, нужен алгоритм который с помощью opencv проведет сегментацию.

[Сегментация клеток с помощью opencv и python]

Здравствуйте.

Есть вот такая картинка: 

 

Необходимо определить область каждой клетки, отделить ее от соседней, обвести контуром. Некоторые клетки находятся в процессе деления, их необходимо выделить особенно (другим цветом). Также надо посчитать количество клеток. Каждая клетка должна превратится в некий объект для дальнейшего анализа. Вот такая задача сегментации. Пытаюсь решать ее с помощью opencv и python. В opencv я совсем новичок, поэтому для начала попробовал алгоритм из документации для сегментации монет: https://docs.opencv.org/3.3.1/d3/db4/tutorial_py_watershed.html Но для моей картинки это не подходит, контуры плохо выделяются, получается каша. Видимо это из-за того что внутренности клетки примерно одно цвета с фоном. Пробовал играться с параметрами, но безуспешно. Добился вот такой картинки:

На этом этапе и застрял.  Сомневаюсь что я двигаюсь в правильном направлении.

Мой вопрос:

1. Какой алгоритм подошел бы мне?

2. С чего начинать?

3. Что почитать на этот счет?

 

Заранее благодарю.