в отладчике работает, наверное не так что-то иниицализирую?
Mat distort_mat, new_instrisic_mat, _dst;
_dst.create( image.size(), image.type());
int stripe_size0 = image.rows;
Mat map1(stripe_size0, image.cols, CV_32FC(1)), map2(stripe_size0, image.cols, CV_32FC(1));
Mat R = Mat_<double>::eye(3,3);
Mat_<double> A, Ar;
intrinsic_Matrix.convertTo(A, CV_64F);
initUndistortRectifyMap(A, distortion_coeffs2, R, A, map1.size(), map1.type() , map1, map2);